Ну, во-первых вы FX5U-32M ни одним из "FX-PCS-WIN, GX IEC Developer (FX), GX Developer (FX)" не сможете программировать. А для FX2n-48ER этот список почти как от старого к новому.
Для FX2N можете выбрать функционально блочную схему как у GX IEC Developer, или релейную схему как у GX Developer - каждому свое нравится. И эти два вида обьеденены в GX Works2 - тоже там можно программировать и это самая новая программа через которую можно (с поддержкой профибаса и прочего).
Для FX5U (чет какой-то разброс fx2 и fx5 вообще разные и по ПО и по тому как програмить) есть только GX Works3 - вся программа только под этот плк сделана.
Для GOT2000 качайте GT Works3.
Все ПО платные, но можно найти где скачать, например,
тут и
тут. А серийный ключ для ввода при установке в интернете найдете сами.